Trascrittoma sequenziamento che identifica l'impatto di Rare non codificanti varianti

Crescita recente e rapida popolazione umana ha portato al un accesso di varianti genetiche rare che si prevede di contribuire al fardello genetico di un individuo dal rischio di malattia. Ad oggi, gran parte del fuoco è stato sulle varianti codificanti proteine rare, per le quali l'impatto potenziale puo' essere stimata dal codice genetico, ma determinare l'impatto delle varianti non codificanti rare è stato piu' impegnativo. Per migliorare la nostra comprensione di tali varianti, abbiamo combinato i dati di sequenziamento del genoma RNA e di sequenziamento di alta qualita' da un 17-individuale, famiglia di tre generatori per contrastare espressione loci di carattere quantitativo ( eQTLs) e splicing carattere quantitativo loci ( sQTLs) all'inaterno di questa famiglia di eQTLs e sQTLs all'interno di un campione di popolazione. Utilizzando questo progetto, a mio avviso, abbiamo scoperto che eQTLs e sQTLs con grandi effetti in famiglia sono stati arricchiti con rare varianti di regolamentazione e di splicing con frequenza dell'allele minore < 0,01. Essi sono stati anche maggiori probabilita' di influenzare i geni essenziali ed i geni coinvolti nelle malattie complesse. Inoltre, abbiamo testato la capacita' dei diversi non codificante l'annotazione di prevedere l'impatto di varianti non codificanti rare. Abbiamo scoperto che la distanza al sito di inizio della trascrizione, vincolo evolutivo, e l'annotazione epigenetica erano notevolmente piu' informativa per prevedere l'impatto di varianti rare che per prevedere l'impatto di varianti comuni. Questi risultati evidenziano che le varianti non codificanti rare sono contributori importanti a singoli profili di espressione genetica e dimostrano inoltre una capacita' significativa per l'annotazione genomica per prevedere l'impatto delle varianti non codificanti rare.