martedì 31 gennaio 2017

Interazioni dei cambiamenti climatici con le invasioni biologiche e uso del suolo nelle isole Hawaii: modellare il destino di uccelli endemici utilizzando un sistema di informazione geografica

Astratto I honeycreepers Hawaii (Drepanidae) rappresentano una superba illustrazione della radiazione evolutiva, con un singolo evento colonizzazione dando luogo a 19 specie esistenti e almeno il 10 estinti [Curnutt, J. & Pimm, S. (2001) Stud. Biol aviaria. 22, 15-30]. Essi rappresentano anche un drammatico esempio di estinzione di origine antropica. Colture e pascoli ha sostituito il loro habitat forestali, e le introduzioni umani di predatori e malattie, in particolare di zanzare e la malaria aviaria, li ha eliminato dai restanti foreste a basso e medio-elevazione. Paesaggio analisi dei tre rifugi forestali di alta quota mostrano che il cambiamento climatico antropogenico è probabile che si combinano con ultimi cambiamenti di uso del suolo e le invasioni biologiche per guidare alcune delle rimanenti specie all'estinzione, in particolare sulle isole di Kauai e Hawaii. Prove fossili dimostrano che le isole Hawaii erano un tempo sede di più di 100 specie endemiche e sottospecie di terra e di acqua uccelli ( 1 ). L'arrivo di polinesiani e, successivamente, gli europei e gli altri coloni ha chiuso l'isolamento che ha favorito l'evoluzione di questa variegata avifauna. Attualmente, 48 delle oltre 100 specie originali sono elencati come esistente; tuttavia, 11 di queste specie non sono stati osservati in più di un decennio e sono probabilmente estinto ( 2 ). Fino ad oggi, le estinzioni delle honeycreepers, in particolare, sono stati guidati in gran parte dalla perdita di habitat, i predatori introdotti, e le malattie ( 3-6 ). La perdita di habitat è iniziato con coloni polinesiani, che eliminato gran parte della bassa elevazione e stagionalmente secca foresta per scopi agricoli ( 7 ). Gli europei e gli altri coloni ha introdotto nuove tecnologie agricole e animali domestici supplementari; l'introduzione di bovini e ovini in particolare ha portato allo sviluppo di pascoli nella foresta alta elevazione che riduce ulteriormente la quantità di habitat adatto per gli uccelli di foresta nativa ( 8 , 9 ). Oggi, la distribuzione dei montane foresta pluviale tropicale è vincolata da agricoltura e lo sviluppo urbano a bassa elevazione e pascoli rimane il principale uso del suolo umano ad alta quota. I polinesiani cacciato alcuni uccelli per il cibo e le piume e ratti e cani anche introdotte che hanno predato sugli uccelli nidificanti. Coloni successivi introdotti diversi predatori supplementari, più in particolare manguste, gatti e due ulteriori specie di ratti. Per gli uccelli nativi della foresta-dimora, honeycreepers in particolare, l'introduzione accidentale di zanzare e vaiolo aviario, e la malaria, più recentemente aviaria, ha avuto le maggiori conseguenze. La ricerca sul campo nelle foreste delle Hawaii mostra che abbondanze di uccelli nativi, malaria prevalenza del parassita, e livelli di zanzara vettore variano prevedibilmente lungo gradienti di elevazione (Rif. 5 , Fig. 1 ). La zanzara ha introdotto, Culex quinquefasciatus , è presente in numero elevato a quote più basse, dove molti uccelli introdotti e quasi non vengono trovati uccelli nativi. Perché gli uccelli introdotte sono resistenti alla malaria, la prevalenza di Plasmodium nelle popolazioni aviarie da quelle altitudini è basso. La malaria prevalenza aumenta in modo significativo nella foresta a metà altezza, corrispondenti alle quote più basse in cui uccelli nativi si trovano attualmente, e qui la trasmissione della malaria per uccelli nativi è significativo ( 10 ). Ad altitudini più elevate, sia Culex popolazioni e prevalenza di Plasmodium declino mentre gli uccelli nativi raggiungono la loro abbondanza e la diversità di picco. Queste foreste di alta quota sono l'ultimo rifugio per 10 specie di uccelli della foresta in via di estinzione, di cui 8 honeycreepers: il rampicante Hawaii ( Oreomystis mana ), palila ( Loxioides bailleui ), àkiapola AU ( hemignathus munroi ), Hawaii àkepa ( Loxops c. coccineus ), e Alala ( Corvus hawaiiensis ) dell'isola di Hawaii, la PALMERIA DOLEI ( Palmeria Dolei ), Parrotbill ( xanthophrys Pseudonestor ), e po Ouli ( Melamprosops phaeosoma ) di Maui, e il puaiohi ( Myadestes Palmeri ) e Kauai àkepa ( Loxops c. caeruleirostris ) di Kauai. Diverse altre specie rimangono federale elencati come in via di estinzione, ma c'è poca speranza che eventuali individui sopravviveranno. Altre specie autoctone restano abbondanti in queste foreste di elevazione superiori, anche se alcuni di loro sono in calo pure. Fig. 1. In una nuova finestra Scarica PPT Fig. 1. Un modello generalizzato di abbondanze uccello nativo, malaria incidenza dei parassiti, e livelli di zanzara vettore lungo un gradiente di elevazione alle Hawaii [riprodotto con permesso da rif. 5 (Copyright 1986 Gruppo ecol. Soc. Am.)]. Vi è sostanziale evidenza da studi di umana e malaria aviaria che lo sviluppo di Plasmodium parassiti all'interno zanzare dipende dalla temperatura e che vi è una temperatura soglia sotto la quale Plasmodium non può sviluppare al suo stadio infettivo ( 11 , 12 ). In Hawaii, la temperatura di soglia per la trasmissione di Plasmodium relictum è stata stimata essere di 13 ° C, mentre picco Plasmodium prevalenza nelle zanzare selvatiche si verifica nelle foreste metà elevazione in cui la temperatura media estiva ambiente è di 17 ° C ( 10 ). Potrebbe il cambiamento climatico antropogenico aggravare gli effetti di una malattia in funzione della temperatura introdotto, guidando molti dei restanti uccelli nativi oltre il limite di estinzione? Le caratteristiche climatiche principali di foreste montane delle Hawaii sono il nord-est alisei e l'associato inversione di trade-vento. L'altitudine di questa inversione media 1.900 m; sopra di tale altitudine, umidità e precipitazioni declino rapido, stabilendo un limite massimo di vegetazione forestale ( 13 ). Anche se le isole Hawaii sono marittima, e quindi relativamente ben tamponata climaticamente, studi palinologici mostrano che entrambe le temperature locali e l'elevazione dell'inversione commercio-vento hanno risposto sostanzialmente alle variazioni climatiche del passato ( 14-16 ). Come sarà il cambiamento climatico globale influenzare il clima regionale e locale nelle foreste pluviali montane hawaiane? Anche se le previsioni dettagliate di clima regionale restano incerte, soprattutto ai tropici, recenti studi che si sono concentrati sulle foreste montane delle Neotropics forniscono qualche evidenza di una risposta climatica comune in uno scenario di riscaldamento. Sulla base di simulazioni climatiche globali sotto elevati di CO 2 condizioni, ancora et al. ( 17 ) suggeriscono che il riscaldamento della superficie del mare nel Pacifico provocherà un'intensificazione del ciclo idrologico tropicale, che a sua volta causare il rilascio di calore latente dopo la condensazione, riscaldando l'atmosfera. Da questi risultati, Still et al. ( 17 ) e Pounds et al. ( 18 ) suggeriscono un aumento del livello di condensazione sollevamento e l'altezza delle nubi orografiche. Questi cambiamenti, definito l'ipotesi di cloud-base di sollevamento, aumenterebbe sia i limiti altitudinali inferiori e superiori di foreste pluviali montane ( 19 ). Le modifiche coerenti con questa previsione sono stati osservati in foreste montane dell'America Centrale, anche se un meccanismo alternativo, controvento disboscamento delle foreste di pianura, anche potrebbe aumentare convettivo e base delle nubi orografiche ( 20 ). In Hawaii, il limite del bosco superiore sul Haleakala, Maui è aumentato in elevazione durante l'optimum climatico dell'Olocene quando radiativo postglacial forzatura era al suo massimo ( 21 ). Questa osservazione è coerente con l'ipotesi di sollevamento cloud-base. In alternativa, Loope e Giambelluca ( 22 ) suggeriscono che la fase di El Niño di El Niño / Southern Oscillation potrebbe fornire un analogo per le conseguenze locali di un mondo più caldo. In queste condizioni, temperature più elevate sono associate con la siccità alta quota, che alla fine avrebbe deprimere i limiti della foresta nuvola. Nella nostra analisi, abbiamo ipotizzato che il sollevamento basi cloud e aumenti di treeline superiore elevazione sarà predominante. L'alternativa di siccità superiore elevazione e un treeline depresso sarebbe molto più dannoso per le foreste delle Hawaii e alle honeycreepers che essi supportano. Sezione precedente Sezione successiva metodi Abbiamo valutato i probabili effetti del cambiamento climatico sulla misura delle foreste a basso rischio per la malaria aviaria per tre isole Hawaii: Hawaii, Maui, e Kauai. All'interno di ogni isola abbiamo scelto una specifica rappresentante zona della foresta più intatto e più alta abbondanza di uccelli nativi: la Hakalau National Wildlife Refuge sull'isola di Hawaii, la Foresta Hanawi a Maui, e la regione Alakai Palude su Kauai. Federali, statali e / o privati ​​di gestire tutte queste aree come parchi e / o conserva per la conservazione; tutti sostenere la ricerca sostanziale sulle honeycreepers Hawaii in via di estinzione. Abbiamo ipotizzato che un aumento di 2 ° C nelle temperature regionali sarebbe avvenuto da qualche tempo in ritardo nel prossimo secolo, in linea con le previsioni del clima-modello per la regione. Si presume inoltre che l'inversione trade-vento aumenterebbe in quota, portando un aumento delle precipitazioni alle foreste di alta quota. Infine, abbiamo ipotizzato che il tasso di variazione della temperatura e di espansione nella trasmissione della malaria sarà sostanzialmente più rapido del tasso di espansione bosco sopra il limite del bosco corrente. Le nostre analisi hanno comportato proiettando spazialmente le isoterme per le temperature critiche per Plasmodium sviluppo sia in condizioni correnti e un 2 ° C il riscaldamento scenario. Utilizzando un 30-m US Geological Survey modello digitale per ogni isola e un gradiente di ≈6.5 ° C / km ( 23 ), abbiamo mappato la posizione dei C isoterme 17 e 13 ° come strato di dati vettoriali. L'area al di sotto del 17 ° C isoterma (aumento della temperatura) è la regione in cui l'infezione malarica è certa, e al di sopra della C isoterma di 13 ° (diminuzione della temperatura) lo sviluppo del parassita non si verifica. Successivamente, abbiamo sovrapposto le coperture vettore dei confini rifugio e isoterme di temperatura su un composito satellitare falsi colori l'immagine Terre (SPOT) via satellite di osservazione de la raccolta nel mese di gennaio del 1995. Abbiamo poi calcolato la variazione di area di riserva della foresta sotto la Pour più caldo scenario clima per le seguenti tre zone di temperatura: sopra 17 ° C, compresa tra 17 e 13 ° C, e sotto i 13 ° C. Queste zone corrispondono ad una zona ad alto rischio di infezione di malaria (sopra 17 ° C), una zona di transizione in cui è possibile ma limitato (tra 17 e 13 ° C) alcune trasmissioni, ed una zona a basso rischio (foresta alta elevazione a o inferiore a 13 ° C) rispettivamente. Alcune infezioni malariche sono presenti in queste zone a basso rischio, ma possono riflettere la mobilità degli uccelli. La trasmissione, se si verifica affatto nel zona di temperatura più alta, è probabile breve, episodica e limitata a periodi di clima caldo (rif. 24 e CTA, dati non pubblicati).

mercoledì 25 gennaio 2017

regressione istopatologico dopo docetaxel neoadiuvante, oxaliplatino, fluorouracile e leucovorin rispetto epirubicina, cisplatino e fluorouracile o capecitabina in pazienti con adenocarcinoma resecabile giunzione gastrica o gastro-esofageo (FLOT4-AIO)

In questo manoscritto, Al Batran et al. presentare i risultati dello studio tedesco FLOT4-AIO, in cui 300 pazienti con i pazienti con cancro gastrico operabile sono stati trattati con tre cicli di neoadiuvante ECX / ECF (epirubicina, cisplatino e 5-fluorouracile o capecitabina) chemioterapia o quattro cicli di neoadiuvante FLOT ( 5-fluorouracile, leucovorin, oxaliplatino e docetaxel) chemioterapia. L'endpoint primario di questa componente di fase II dello studio era la risposta patologica completa in base a criteri Becker. Il regime FLOT è risultato associato a tassi più elevati di statisticamente patologica completa regressione di ECX / ECF [16% vs 8%; p = 0 · 02). Non ci sono state differenze significative nella percentuale di pazienti con linfonodi coinvolti nel campione di resezione (N1 o superiore) tra i bracci dello studio. Questi risultati sono di interesse, come più alti tassi di risposta patologica in ambito perioperatorio potrebbe tradursi in tassi più alti di chirurgia curativa a causa di downstaging tumore. In effetti, più pazienti nel ECX che nel FLOT non procedere a un intervento chirurgico (19% contro 7%); nella maggior parte dei casi questo è dovuto alla rilevazione della malattia non resecabile o metastasi prima dell'intervento chirurgico. Tuttavia, c'era anche uno squilibrio nella proporzione di tumori giunzionali gastroesofagei nel braccio ECX dello studio (52% vs 43%), che può aver influenzato i tassi di resezione chirurgica. tossicità correlate chemioterapia erano come previsto per questi regimi; ECX è stato associato a più alti tassi di nausea e vomito, mentre FLOT è stato associato a più alti tassi di neutropenia significativo e neuropatia. Modifiche della dose sono stati anche simili fra i due bracci di trattamento (42% vs 38% ECX FLOT), tuttavia la chemioterapia sospensione su richiesta dei pazienti era più alta nei pazienti trattati con ECX / ECF (14% vs 8%). La vera questione riguardo a questo studio è se i tassi di miglioramento della risposta patologica possono tradursi in miglioramenti nella sopravvivenza globale per i pazienti con cancro resecabile gastroesofageo. Non è chiaro che i tassi di risposta patologica sono un predittore indipendente di sopravvivenza globale, come altri fattori, in particolare metastasi linfonodali, possono essere più importanti. Ciò è stato recentemente dimostrato in un'analisi retrospettiva dello studio magico in cui la risposta patologica alla chemioterapia era un predittore di sopravvivenza globale All'analisi univariata, ma quando valutato in combinazione con lo stato dei linfonodi, non ha mantenuto il suo valore predittivo (Smyth et al, JCO 2016). Ciò significa che anche se FLOT migliora la risposta patologica del tumore primario, se la proporzione di pazienti con linfonodi metastatici non è anche diminuito, allora la sopravvivenza globale non può migliorare per questi pazienti. La mancanza di impatto della regressione del tumore patologica sulla sopravvivenza globale è supportata anche dai risultati dello studio OE05, in cui l'intensificazione della chemioterapia perioperatoria (quattro cicli di ECX rispetto a due cicli di CF) migliorati i tassi di risposta patologica del tumore primario, ma non migliorare la sopravvivenza globale (Cunningham ASCO 2015). Attuali linee guida internazionali raccomandano cisplatino e chemioterapia a base di fluoropirimidine perioperatoria per i pazienti con cancro gastrico operabile (ESMO 2016), l'uso di epirubicina regimi contenenti è anche adatto per i pazienti con un buon performance status. Al momento, come non ci sono dati di sopravvivenza è disponibile per FLOT perioperatoria, l'uso di questo regime non può essere raccomandato in ambito perioperatorio. Tuttavia, i risultati dello studio FLOT 4 sono incoraggianti, e non vediamo l'ora di rivedere i risultati complessivi di sopravvivenza dello studio quando disponibile. Leggi di più Contenuto relativo FOLFIRI più Cetuximab contro FOLFIRI più bevacizumab per il tumore del colon-retto metastatico (FIRE-3): un'analisi post-hoc delle dinamiche tumorali nella finale RAS wild-type sottogruppo di questo randomizzati in aperto di fase 3 di prova Ramucirumab in combinazione con FOLFOX come terapia di prima linea per la avanzato dell'esofago, giunzione gastroesofagea, o adenocarcinoma gastrico: uno studio randomizzato, in doppio cieco, multicentrico di fase II trial Argomento: Articoli su chemioterapia e chemioradioterapia a cancro gastrico HER2 eterogeneità nei tumori gastrici / gastroesofageo: Da benchside alla pratica Topic: Gli articoli sulla terapia mirata in cancro gastrico Migliorare i risultati in resecabile cancro gastrico: una revisione della attuale e strategie future Topic: articoli generali sul cancro gastrointestinale A Randomized Studio di fase II di FOLFOX con o senza l'MET inibitore Onartuzumab in Advanced adenocarcinoma dello stomaco e gastroesofageo Junction Argomento: Articoli su chemioterapia e chemioradioterapia a cancro gastrico

lunedì 16 gennaio 2017

Epidemiologia: Teoria Epidemic

Controllo delle malattie trasmissibili è considerato in dettaglio in una sezione separata del MFPH Parte A programma - Vedere Modulo 2g: malattie trasmissibili . Questa pagina descrive i principi di base della teoria epidemia. tasso di riproduzione di base - (R0) Il tasso di riproduzione base (R0) è utilizzato per misurare il potenziale trasmissione di una malattia. Si è pensato come il numero di infezioni secondarie prodotte da un caso tipico di un'infezione in una popolazione che è totalmente suscettibile. 1 Si può quindi essere misurata contando il numero di casi secondari a seguito dell'introduzione di una infezione in una popolazione totalmente suscettibile. Ad esempio, se il R0 per il morbillo in una popolazione è 15, quindi ci si aspetterebbe di diffondersi rapidamente perché ogni nuovo caso di morbillo avrebbe prodotto 15 nuovi casi secondari. R0 esclude nuovi casi prodotte dai casi secondari etc. Il tasso di riproduzione di base è influenzata da diversi fattori: Il tasso di contatti nella popolazione ospitante La probabilità di infezione viene trasmesso durante il contatto La durata dell'infettività In generale, per un'epidemia a verificarsi in una popolazione suscettibile R0 deve essere> 1, quindi il numero di casi è in aumento. 1 Se R In molte circostanze non tutti i contatti saranno suscettibili all'infezione. Cioè, alcuni contatti saranno immuni, per esempio a causa di un'infezione precedente che ha conferito immunità permanente, o come risultato di vaccinazione precedente. Pertanto, non tutti i contatti saranno infettarsi e il numero medio di casi secondari per caso infettive diminuirà. Si misura il tasso di riproduzione effettiva (R) tasso di riproduzione effettivo (R) Una popolazione raramente sarà totalmente suscettibile ad un'infezione nel mondo reale. Il tasso di riproduzione effettiva (V) stima che il numero medio di casi secondari per caso infettiva in una popolazione costituita da due ospiti sensibili e non sensibili. Può essere pensato come il numero di infezioni secondarie prodotte da un infettiva tipica. R = r0x È il tasso di riproduzione base scontata dalla frazione della popolazione host che è suscettibile (x). Ad esempio, se R0 per l'influenza è 12 in una popolazione dove la metà della popolazione è immune, il tasso di riproduzione efficace per l'influenza è di 12 x 0,5 = 6. Pertanto in queste circostanze un unico caso di influenza produrrebbe una media di 6 nuovi secondaria casi. 1 Per eliminare correttamente una malattia da una popolazione, R deve essere mantenuto herd immunity immunità mandria si verifica quando una parte significativa della popolazione (o la mandria) sono stati vaccinati, e questo fornisce una protezione per gli individui non protetti. Maggiore è il numero di persone che sono state vaccinate in una popolazione, minore è la probabilità che un (non sono vaccinati) persona suscettibile entrerà in contatto con l'infezione. E 'più difficile per le malattie a diffondersi tra gli individui, se i grandi numeri sono già immuni, e la catena di infezione è rotto. La soglia di herd immunity è la proporzione di una popolazione che ha bisogno di essere immuni al fine di una malattia infettiva a diventare stabile in quella comunità. Se questo è raggiunto, ad esempio per l'immunizzazione, allora ogni caso porta a un singolo nuovo caso e l'infezione diventerà stabile all'interno della popolazione. Questo è R = 1. Se la soglia è superata, allora R Si tratta di una misura importante utilizzata nel controllo delle malattie infettive e programmi di immunizzazione e di eradicazione. epidemie Una epidemia è definita come un aumento della frequenza di occorrenza di una malattia in una popolazione sopra la linea di base o livello previsto in un dato periodo. 2 Il termine è usato in senso ampio e il numero dei casi e il periodo di tempo sono spesso non specificato. In genere è più diffusa di quanto un focolaio, che implica di solito due o più casi epidemiologicamente legati, anche se i due termini sono stati usati in modo intercambiabile. Inoltre, il termine è stato usato anche per descrivere livelli crescenti di malattie non trasmissibili, come ad esempio un 'epidemia di malattie cardiovascolari.' La definizione di cui sopra è molto generale, ma il termine è stato definito quantitativamente per alcune infezioni ed è selezionato un limite oltre il quale si applica il termine 'epidemia'. Ad esempio, la Health Protection Agency (HPA) controlla i livelli di influenza in Inghilterra e Galles nella stagione influenzale, da ottobre a maggio, sulla base di dati provenienti da GP consultazioni e le diagnosi di laboratorio. La HPA ha definito la soglia di riferimento per 'attività stagionale normale' in Inghilterra come 50 GP consultazioni a settimana / 100.000 abitanti. La soglia epidemica sarebbe stato raggiunto se il numero di consultazioni ha superato 200 a settimana / 100,000. 3 gestione delle epidemie